Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRRT4C9JH25 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms