Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms