Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNFSF18Q9UNG2 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms