Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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