Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms