Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms