Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM27Q9HBJ8 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms