Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LNPKQ9C0E8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms