Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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