Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CELF4Q9BZC1 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms