Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCGF6Q9BYE7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCGF6Q9BYE7 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms