Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms