Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms