Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HPS3Q969F9 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HPS3Q969F9 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms