Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113Q902F9 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms