Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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RTL8BQ17RB0 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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