Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CNGA3Q16281 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CNGA3Q16281 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CNGA3Q16281 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNGA3Q16281 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNGA3Q16281 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNGA3Q16281 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNGA3Q16281 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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