Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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CDSNQ15517 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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