Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKIV2LQ15477 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms