Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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