Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAM2Q15035 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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