Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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