Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC022167.5-201ENST00000636296 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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