Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GBX1Q14549 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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GBX1Q14549 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GBX1Q14549 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
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