Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTTNQ14247 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms