Protein–RNA interactions for Protein: Q13795

ARFRP1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFRP1Q13795 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARFRP1Q13795 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARFRP1Q13795 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARFRP1Q13795 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARFRP1Q13795 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ARFRP1Q13795 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms