Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL4AQ13619 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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