Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB40BQ12829 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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