Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms