Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms