Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SOX4Q06945 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms