Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms