Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms