Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PITPNAQ00169 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PITPNAQ00169 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms