Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COG7P83436 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms