Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms