Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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USP46P62068 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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USP46P62068 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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USP46P62068 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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USP46P62068 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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USP46P62068 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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USP46P62068 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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USP46P62068 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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USP46P62068 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP46P62068 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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