Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NLRP12P59046 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms