Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms