Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCA4P51532 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms