Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 LYG1-201ENST00000308528 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSEN1P49768 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms