Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FNTBP49356 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FNTBP49356 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FNTBP49356 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms