Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM4SF4P48230 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms