Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRXP46100 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRXP46100 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms