Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGAEP38570 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms