Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DDIT3P35638 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms