Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms