Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PLNP26678 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PLNP26678 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms