Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR1P24390 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KDELR1P24390 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KDELR1P24390 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KDELR1P24390 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KDELR1P24390 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KDELR1P24390 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KDELR1P24390 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KDELR1P24390 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms