Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TFE3P19532 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TFE3P19532 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFE3P19532 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFE3P19532 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFE3P19532 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFE3P19532 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFE3P19532 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFE3P19532 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFE3P19532 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFE3P19532 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TFE3P19532 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFE3P19532 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFE3P19532 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFE3P19532 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFE3P19532 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFE3P19532 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFE3P19532 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms